医療系SEはきついって本当?リアルな大変さとメリットを紹介
2023/01/25
2025/11/06
「医療系SEはきつい」と言われる場合がありますが、他業界のSEと比べてどういった点がきついのでしょうか。
この記事では、医療系SEに興味がある人向けに、きついと感じやすいポイントやメリットを解説します。実情を知り、転職先選びの参考にしましょう。
この記事では、医療系SEに興味がある人向けに、きついと感じやすいポイントやメリットを解説します。実情を知り、転職先選びの参考にしましょう。
医療系SEってそもそもどんな職業?仕事内容も詳しく解説
医療系SEがきついか解説する前に、そもそもどんな仕事なのかを解説します。
実は、医療系SEには「院内SE」と「医療システム開発SE」の2種類があり、働き方や仕事内容が異なります。それぞれ解説します。
(1)院内SE
院内SEは、医療機関の職員として常駐し、院内システムやPC、周辺機器の保守・管理や、ネットワーク管理、ヘルプデスク業務などを担当します。一般的な社内SEと同じく、院内のIT周りに幅広く携わり、システムをスムーズに使えるようにする仕事です。
現在の医療現場では、電子カルテや医療事務用システム、医療機器など、さまざまなシステムが使われています。
院内SEは、医師・看護師・医療事務などさまざまな職種の人と、IT機器・ネットワークシステムの橋渡しをするポジションです。
院内の職員がスムーズにシステムを利用できるよう、操作方法などの使い方やトラブル時の対応を指導します。
また、ヘルプデスク業務ではシステムやパソコンについてさまざまな相談や要望を受け、対応しなければいけません。
そのため、一般的なSEのスキルに加え、医療と医療事務に関連する知見が必要となります。1つの領域に特化するのではなく、幅広く「IT周りの便利屋」として仕事をするのが院内SEの特徴なのです。
(2)医療システム開発SE
医療システム開発SEは開発会社に勤務し、医療現場で使用する業務システムやパッケージソフトの開発・保守・運用などを行います。
一般的な開発エンジニアと基本的には同じ仕事内容ですが、医療機関の情報管理や業務効率化などに重要なシステムを開発するため、より責任が重い職種です。
医師はシステムの情報を参考に診察を行うため、エラーやトラブルがあると、患者の命や健康を脅かしかねません。また、システムで取り扱う情報は、病歴など秘匿性の高い個人情報が多く、万が一、漏洩した場合は社会問題になるリスクがあります。
システム開発のスキルに加え、そうした医療業界ならではの注意点への知識・理解も求められる職業です。
このように、院内SEと医療システム開発SEは同じ医療系のシステムエンジニアながら、役割は全く異なります。それぞれのきつい点について解説します。
実は、医療系SEには「院内SE」と「医療システム開発SE」の2種類があり、働き方や仕事内容が異なります。それぞれ解説します。
(1)院内SE
院内SEは、医療機関の職員として常駐し、院内システムやPC、周辺機器の保守・管理や、ネットワーク管理、ヘルプデスク業務などを担当します。一般的な社内SEと同じく、院内のIT周りに幅広く携わり、システムをスムーズに使えるようにする仕事です。
現在の医療現場では、電子カルテや医療事務用システム、医療機器など、さまざまなシステムが使われています。
院内SEは、医師・看護師・医療事務などさまざまな職種の人と、IT機器・ネットワークシステムの橋渡しをするポジションです。
院内の職員がスムーズにシステムを利用できるよう、操作方法などの使い方やトラブル時の対応を指導します。
また、ヘルプデスク業務ではシステムやパソコンについてさまざまな相談や要望を受け、対応しなければいけません。
そのため、一般的なSEのスキルに加え、医療と医療事務に関連する知見が必要となります。1つの領域に特化するのではなく、幅広く「IT周りの便利屋」として仕事をするのが院内SEの特徴なのです。
(2)医療システム開発SE
医療システム開発SEは開発会社に勤務し、医療現場で使用する業務システムやパッケージソフトの開発・保守・運用などを行います。
一般的な開発エンジニアと基本的には同じ仕事内容ですが、医療機関の情報管理や業務効率化などに重要なシステムを開発するため、より責任が重い職種です。
医師はシステムの情報を参考に診察を行うため、エラーやトラブルがあると、患者の命や健康を脅かしかねません。また、システムで取り扱う情報は、病歴など秘匿性の高い個人情報が多く、万が一、漏洩した場合は社会問題になるリスクがあります。
システム開発のスキルに加え、そうした医療業界ならではの注意点への知識・理解も求められる職業です。
このように、院内SEと医療システム開発SEは同じ医療系のシステムエンジニアながら、役割は全く異なります。それぞれのきつい点について解説します。
院内SEはきついって本当?大変なポイント5選
院内SEがきついといわれる主なポイントを5つ紹介します。
(1)現場からのプレッシャー
院内SEのもとには、院内で使用しているさまざまなシステムのトラブル対応や質問が集まります。そのため、複数の部署から一度に依頼が来て、優先順位をつけ対応しなければいけないケースもあります。
システムが通常通り動かないと現場での業務が進まないケースもあるので、待たせると多忙な医療従事者からクレームが来るケースも少なくありません。
システム開発に携わるSEと異なり、納期に追われる場面はほぼありませんが、現場からのプレッシャーは大きいといえるでしょう。
(2)システムやPCの入れ替え時はハードワーク
院内SEはトラブルなどがなければ、基本的に定時で帰れます。しかし、使用しているシステムのリプレイスやPCの入れ替え時は例外です。
作業量が多いため残業が続き、非常にきついと感じるでしょう。5〜10年に1回の頻度ですが、慣れないハードワークに心身ともに疲れてしまうかもしれません。
(3)医療に使うシステムならではの責任
患者の状態や病歴などが記載された電子カルテは、医師が薬局に患者さんに出す薬を指示したり、検査で得たデータを確認したりと診療において欠かせないものです。
もし、トラブルによって電子カルテが使えなくなると、場合によっては患者の命や健康に関わります。
そのため、一般的な社内SEよりも大きな責任がのしかかり、きついと感じるかもしれません。
(4)職員とのコミュニケーション
電子カルテは院内のほぼ全ての部署で使用します。そのため、院内SEは医師・看護師・放射線技師・薬剤師など、さまざまな職種の職員から、問合せや相談を受けることになります。
関わる人数が多いため、一人ひとりに合わせた柔軟なコミュニケーションをとる力が必要です。また、パソコンが不得意な職員にもわかるよう、対応しなければいけません。
さらに医療従事者は、人命に関わる責任の重い仕事をしている、極めて多忙といった理由から、大きなストレスを抱えています。ストレスがもとで院内SEに強く当たる人もいるため、人間関係をきついと感じる場合もあるでしょう。
(5)まれに休日に連絡が来る
多くの医療機関では、数人の院内SEが交代で業務を担当しています。そのため、すぐに解決できるトラブルであれば出勤している院内SEが対応します。しかし、大きなトラブルの場合は、休日にもかかわらず呼び出される可能性もあるでしょう。
(1)現場からのプレッシャー
院内SEのもとには、院内で使用しているさまざまなシステムのトラブル対応や質問が集まります。そのため、複数の部署から一度に依頼が来て、優先順位をつけ対応しなければいけないケースもあります。
システムが通常通り動かないと現場での業務が進まないケースもあるので、待たせると多忙な医療従事者からクレームが来るケースも少なくありません。
システム開発に携わるSEと異なり、納期に追われる場面はほぼありませんが、現場からのプレッシャーは大きいといえるでしょう。
(2)システムやPCの入れ替え時はハードワーク
院内SEはトラブルなどがなければ、基本的に定時で帰れます。しかし、使用しているシステムのリプレイスやPCの入れ替え時は例外です。
作業量が多いため残業が続き、非常にきついと感じるでしょう。5〜10年に1回の頻度ですが、慣れないハードワークに心身ともに疲れてしまうかもしれません。
(3)医療に使うシステムならではの責任
患者の状態や病歴などが記載された電子カルテは、医師が薬局に患者さんに出す薬を指示したり、検査で得たデータを確認したりと診療において欠かせないものです。
もし、トラブルによって電子カルテが使えなくなると、場合によっては患者の命や健康に関わります。
そのため、一般的な社内SEよりも大きな責任がのしかかり、きついと感じるかもしれません。
(4)職員とのコミュニケーション
電子カルテは院内のほぼ全ての部署で使用します。そのため、院内SEは医師・看護師・放射線技師・薬剤師など、さまざまな職種の職員から、問合せや相談を受けることになります。
関わる人数が多いため、一人ひとりに合わせた柔軟なコミュニケーションをとる力が必要です。また、パソコンが不得意な職員にもわかるよう、対応しなければいけません。
さらに医療従事者は、人命に関わる責任の重い仕事をしている、極めて多忙といった理由から、大きなストレスを抱えています。ストレスがもとで院内SEに強く当たる人もいるため、人間関係をきついと感じる場合もあるでしょう。
(5)まれに休日に連絡が来る
多くの医療機関では、数人の院内SEが交代で業務を担当しています。そのため、すぐに解決できるトラブルであれば出勤している院内SEが対応します。しかし、大きなトラブルの場合は、休日にもかかわらず呼び出される可能性もあるでしょう。
医療システム開発SEはきついって本当?大変なポイント3選
医療システム開発SEがきついといわれる主なポイントを3つ紹介します。
(1)残業や休日出勤が多い
他のシステム開発SEと同じく、医療システム開発SEも、納期前には残業や休日出勤が多くなります。
また、電子カルテなど使用できないと業務に大きな支障をきたすシステムに異常が起きた場合、開発者全員で復旧を急がなければいけません。
医療現場で使用するシステムのなかには24時間365日稼働するものも多く、トラブル時は休日や夜中でも連絡が来て対応に追われ、きついと感じるケースもあるでしょう。
(2)法律への理解が不可欠
医療機関は人の命や健康に深くかかわるため、さまざまな業務のルールが法律で定められています。例えば、診療録の記載内容などは医師法、調剤については薬剤師法と関係法令は膨大にあるのです。
システム開発時に仕様を決める際も、関連する法律に違反しないよう細心の注意が必要です。万が一、違反すると、減収をはじめさまざまな罰を受けることになります。また、社会的信用も大きく損なわれ、会社経営が危なくなるかもしれません。
(3)資格取得が義務の場合もある
システム開発にあたり医療従事者とすり合わせをする場面もあるため、医療システムSEには、情報と医療どちらの知見も必要です。
勤務先によっては、知識を客観的に証明するために「医療情報技師」という民間資格の取得を義務づけています。忙しい時間をぬって、資格を取得するのをきついと感じる人もいるかもしれません。
(1)残業や休日出勤が多い
他のシステム開発SEと同じく、医療システム開発SEも、納期前には残業や休日出勤が多くなります。
また、電子カルテなど使用できないと業務に大きな支障をきたすシステムに異常が起きた場合、開発者全員で復旧を急がなければいけません。
医療現場で使用するシステムのなかには24時間365日稼働するものも多く、トラブル時は休日や夜中でも連絡が来て対応に追われ、きついと感じるケースもあるでしょう。
(2)法律への理解が不可欠
医療機関は人の命や健康に深くかかわるため、さまざまな業務のルールが法律で定められています。例えば、診療録の記載内容などは医師法、調剤については薬剤師法と関係法令は膨大にあるのです。
システム開発時に仕様を決める際も、関連する法律に違反しないよう細心の注意が必要です。万が一、違反すると、減収をはじめさまざまな罰を受けることになります。また、社会的信用も大きく損なわれ、会社経営が危なくなるかもしれません。
(3)資格取得が義務の場合もある
システム開発にあたり医療従事者とすり合わせをする場面もあるため、医療システムSEには、情報と医療どちらの知見も必要です。
勤務先によっては、知識を客観的に証明するために「医療情報技師」という民間資格の取得を義務づけています。忙しい時間をぬって、資格を取得するのをきついと感じる人もいるかもしれません。
医療系SEはきつい?原因の見極め方と“負担を減らす”実践策
「きつい」と言われがちな医療系SEですが、その多くは“原因”が特定でき、設計と運用でコントロール可能です。本章では、負担の源をチェックリスト化し、現場で効く対策と応募・面接時の見極めポイントをまとめます。
① 24/365運用・オンコール(夜間・休日の障害対応)
② 多職種・多拠点の利害調整(医師・看護部・事務・ベンダ)
③ 医療特有のリスク/高いセキュリティ要件(誤停止が診療へ影響)
④ レガシー環境と個別要件の多さ(院内固有のカスタム・無停止要件)
オンコール体制の明確化:一次/二次、SLO、呼出基準、代休ルールの明文化
監視と自動化:主要業務の死活監視、閾値設計、通知ルーティング、簡易自己復旧の仕組み化
変更管理:診療影響の大きい期間を避ける変更凍結ウィンドウ、ロールバック手順の標準化
セキュリティ・権限設計:最小権限、特権ID管理、脆弱性対応の定期サイクル化
標準準拠の要件定義:標準型電子カルテやガイドラインに沿った“型”を前提に個別要件を最小化
(参考:厚生労働省「医療情報システムの安全管理に関するガイドライン(第6.0版)」)
・直近3か月の夜間呼出件数と一次復旧までの中央値は?
・重大障害の再発防止策(PIR)はどのように運用?
・監視対象(主要KPI)と通知体制(当番・エスカレーション)は?
・変更凍結期間の設定有無と、ロールバック手順の整備状況は?
・ベンダ/院内の役割分担表(RACI)は最新化されている?
・標準準拠(電子カルテ標準化・医療DX施策対応)の基本方針は?
(関連:厚生労働省「医療DXについて」)
“きつさ”の多くは体制設計・運用設計・自動化で平準化できます。応募前・面接時に負荷の源を定量確認し、持続可能な環境を選び取ることが最短ルートです。
(1)“きつさ”の主因(よくある4パターン)
① 24/365運用・オンコール(夜間・休日の障害対応)
② 多職種・多拠点の利害調整(医師・看護部・事務・ベンダ)
③ 医療特有のリスク/高いセキュリティ要件(誤停止が診療へ影響)
④ レガシー環境と個別要件の多さ(院内固有のカスタム・無停止要件)
(2)負担を減らす運用・設計の具体策
オンコール体制の明確化:一次/二次、SLO、呼出基準、代休ルールの明文化
監視と自動化:主要業務の死活監視、閾値設計、通知ルーティング、簡易自己復旧の仕組み化
変更管理:診療影響の大きい期間を避ける変更凍結ウィンドウ、ロールバック手順の標準化
セキュリティ・権限設計:最小権限、特権ID管理、脆弱性対応の定期サイクル化
標準準拠の要件定義:標準型電子カルテやガイドラインに沿った“型”を前提に個別要件を最小化
(参考:厚生労働省「医療情報システムの安全管理に関するガイドライン(第6.0版)」)
(3)面接での“負荷見極め”質問例(コピペ可)
・直近3か月の夜間呼出件数と一次復旧までの中央値は?
・重大障害の再発防止策(PIR)はどのように運用?
・監視対象(主要KPI)と通知体制(当番・エスカレーション)は?
・変更凍結期間の設定有無と、ロールバック手順の整備状況は?
・ベンダ/院内の役割分担表(RACI)は最新化されている?
・標準準拠(電子カルテ標準化・医療DX施策対応)の基本方針は?
(関連:厚生労働省「医療DXについて」)
“きつさ”の多くは体制設計・運用設計・自動化で平準化できます。応募前・面接時に負荷の源を定量確認し、持続可能な環境を選び取ることが最短ルートです。
データでわかる将来性:標準化と普及が“業務をラクにし、需要を増やす”
医療DXの推進で、標準化(つながる・同じルールで扱える)が前提化し、個別対応の泥臭さは縮小。一方で、接続・移行・セキュリティ・運用最適化の案件は継続的に創出されます。医療系SEの将来性はこの“構造”に支えられています。
全国医療情報プラットフォーム、電子カルテ情報共有、診療報酬DX 等の施策が段階的に進行。制度起点の需要は腰が強い。
(出典:厚生労働省「医療DXについて」)
標準型電子カルテや共通仕様準拠が進むほど、要件定義は“再利用可能な型”が中心に。個別要件は“例外”として扱いやすくなる。
データ連携は設計・ガバナンス・セキュリティの“上流価値”が増し、運用も自動化の余地が拡大。
(参考:厚生労働省「電子カルテシステム等の普及状況の推移」(資料PDF))
電子カルテ・電子処方箋・オンライン資格確認の対応拡大に伴い、導入・更改・移行・連携が波状的に発生。
とくに電子処方箋は、医療機関・薬局双方の接続や運用見直しが必要で、院内SE/ベンダSEの関与が続く。
(出典:デジタル庁「電子処方箋の導入状況ダッシュボード」)
標準化の進展=属人化の縮小により、再現性ある実績を積み上げやすく、PM・アーキテクト・セキュリティ等の上流へ展開しやすい。
政策×標準化×普及の三位一体で、医療系SEは働きやすさが増しながら需要は持続します。“個別の泥臭さ”は減り、設計・連携・安全性などコア領域へのシフトで市場価値も高まりやすい構造です。
(1)政策ドライバーが継続
全国医療情報プラットフォーム、電子カルテ情報共有、診療報酬DX 等の施策が段階的に進行。制度起点の需要は腰が強い。
(出典:厚生労働省「医療DXについて」)
(2)標準化で“ラクになる領域”が拡大
標準型電子カルテや共通仕様準拠が進むほど、要件定義は“再利用可能な型”が中心に。個別要件は“例外”として扱いやすくなる。
データ連携は設計・ガバナンス・セキュリティの“上流価値”が増し、運用も自動化の余地が拡大。
(参考:厚生労働省「電子カルテシステム等の普及状況の推移」(資料PDF))
(3)普及の進展=案件が継続的に生まれる
電子カルテ・電子処方箋・オンライン資格確認の対応拡大に伴い、導入・更改・移行・連携が波状的に発生。
とくに電子処方箋は、医療機関・薬局双方の接続や運用見直しが必要で、院内SE/ベンダSEの関与が続く。
(出典:デジタル庁「電子処方箋の導入状況ダッシュボード」)
(4)キャリア的な好循環
標準化の進展=属人化の縮小により、再現性ある実績を積み上げやすく、PM・アーキテクト・セキュリティ等の上流へ展開しやすい。
政策×標準化×普及の三位一体で、医療系SEは働きやすさが増しながら需要は持続します。“個別の泥臭さ”は減り、設計・連携・安全性などコア領域へのシフトで市場価値も高まりやすい構造です。
きついだけじゃない!医療系SEならではの魅力を紹介
医療系SEの醍醐味は、社会インパクト・専門性の伸長・職域の広がりが同時に得られること。政策ドライブで整備が進む医療DXの波に乗り、標準化を軸とした“設計・連携・セキュリティ”の上流価値を発揮できます。
患者・医療者の安全や医療の質に直結するシステムを扱うため、成果がそのまま医療現場の改善に結びつきます。医療DXは「全国医療情報PF/電子カルテ情報の標準化/診療報酬DX」の三本柱で推進され、現場価値の最大化が政策目的として明示されています。
参考:厚生労働省「医療DXについて」
電子カルテ情報共有や標準型電子カルテの普及により、要件定義・データ連携・権限設計・可用性設計など、再利用可能な“型”に基づく上流スキルを体系的に学べます。
参考:厚生労働省「医療分野の情報化の推進について」
電子処方箋・電子カルテの導入・連携は今後も拡大。導入→移行→更改→連携強化が波状的に生まれ、案件が継続します。直近資料でも、薬局側の電子処方箋は高水準で運用が進み、医療機関側のキャッチアップが政策目標として掲げられています。
参考:厚生労働省「電子処方箋・電子カルテの目標設定等について(資料)」 / デジタル庁「電子処方箋の導入状況ダッシュボード」
運用設計・セキュリティ・データ連携・法令準拠など、ベンダSE⇄院内SEの往来が可能なスキルが蓄積されます。将来はPM、セキュリティ(ISMS/脆弱性対応)、データ基盤、アーキテクトへと発展させやすいのが特長です。
用語・職務像の確認:職業情報提供サイト(job tag)
監視・自動復旧・変更凍結・最小権限など、安全管理のガイドラインに沿った運用設計で、オンコールや障害対応の負担を平準化できます。標準仕様準拠を前提に要件を整理するほど、属人化が減り、改善の手が打ちやすくなります。
参考:厚生労働省「医療情報システムの安全管理に関するガイドライン 第6.0版」
一般的なSEスキル(要件定義・設計・テスト・運用)に**医療ドメイン知識(診療フロー、医事、用語、個人情報保護)**が重なることで、希少性×再現性のある人材として評価されやすく、職域選択の幅が広がります。
用語・職務像の確認:職業情報提供サイト(job tag)
政策×標準化×普及が後押しする医療DXの中で、医療系SEは**“社会貢献”と“上流スキルの蓄積”を両立**できます。仕組み化で負荷を下げつつ、設計・連携・セキュリティへ軸足を移すほど市場価値が高まりやすいのが魅力です。
(1) 社会貢献性が高い(仕事の意義が明確)
患者・医療者の安全や医療の質に直結するシステムを扱うため、成果がそのまま医療現場の改善に結びつきます。医療DXは「全国医療情報PF/電子カルテ情報の標準化/診療報酬DX」の三本柱で推進され、現場価値の最大化が政策目的として明示されています。
参考:厚生労働省「医療DXについて」
(2) 標準化の進展で“上流スキル”が身につく
電子カルテ情報共有や標準型電子カルテの普及により、要件定義・データ連携・権限設計・可用性設計など、再利用可能な“型”に基づく上流スキルを体系的に学べます。
参考:厚生労働省「医療分野の情報化の推進について」
(3)市場の追い風で“需要の持続”が見込める
電子処方箋・電子カルテの導入・連携は今後も拡大。導入→移行→更改→連携強化が波状的に生まれ、案件が継続します。直近資料でも、薬局側の電子処方箋は高水準で運用が進み、医療機関側のキャッチアップが政策目標として掲げられています。
参考:厚生労働省「電子処方箋・電子カルテの目標設定等について(資料)」 / デジタル庁「電子処方箋の導入状況ダッシュボード」
(4)キャリアの可塑性が高い(院内/開発どちらでも活きる)
運用設計・セキュリティ・データ連携・法令準拠など、ベンダSE⇄院内SEの往来が可能なスキルが蓄積されます。将来はPM、セキュリティ(ISMS/脆弱性対応)、データ基盤、アーキテクトへと発展させやすいのが特長です。
用語・職務像の確認:職業情報提供サイト(job tag)
(5)“働きやすさ”の伸びしろ(仕組みで軽くできる負荷)
監視・自動復旧・変更凍結・最小権限など、安全管理のガイドラインに沿った運用設計で、オンコールや障害対応の負担を平準化できます。標準仕様準拠を前提に要件を整理するほど、属人化が減り、改善の手が打ちやすくなります。
参考:厚生労働省「医療情報システムの安全管理に関するガイドライン 第6.0版」
(6) “汎用IT×医療知識”のハイブリッドが評価されやすい
一般的なSEスキル(要件定義・設計・テスト・運用)に**医療ドメイン知識(診療フロー、医事、用語、個人情報保護)**が重なることで、希少性×再現性のある人材として評価されやすく、職域選択の幅が広がります。
用語・職務像の確認:職業情報提供サイト(job tag)
政策×標準化×普及が後押しする医療DXの中で、医療系SEは**“社会貢献”と“上流スキルの蓄積”を両立**できます。仕組み化で負荷を下げつつ、設計・連携・セキュリティへ軸足を移すほど市場価値が高まりやすいのが魅力です。
まとめ
医療系SEは、医療機関に常駐し保守・運用やヘルプデスク業務をする院内SEと、システム開発会社で開発・保守・運用をする医療システム開発SEに分けられます。
医療関係ならではの責任の重さや緊急対応のハードさなどきつい点もありますが、安定した業界でやりがいを持って働けます。
もし、医療系SEへの転職に興味がある場合は、まずは医療業界に特化した転職サイトでどのような求人があるのかチェックしましょう。
一般の転職サイトと比べ、医療系SEの求人が豊富なため、リアルな仕事内容や大変さ、魅力を知ることができます。
医療関係ならではの責任の重さや緊急対応のハードさなどきつい点もありますが、安定した業界でやりがいを持って働けます。
もし、医療系SEへの転職に興味がある場合は、まずは医療業界に特化した転職サイトでどのような求人があるのかチェックしましょう。
一般の転職サイトと比べ、医療系SEの求人が豊富なため、リアルな仕事内容や大変さ、魅力を知ることができます。

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